Dal 2000 al 2016 il Dipartimento di Matematica è stato sede amministrativa di un corso per il conseguimento del titolo di Dottore di Ricerca in MATEMATICA, che si è tenuto presso lo stesso Dipartimento.
Nel ruolo di Coordinatore del Dottorato di Ricerca si sono avvicendati i professori Francesco Altomare, Luciano Lopez, Silvia Romanelli, Addolorata Salvatore. Oltre a numerosi docenti del Dipartimento di Matematica, hanno fatto parte del Collegio dei Docenti del Dottorato di Ricerca docenti del Politecnico di Bari e ricercatori del CNR-IAC Bari. Responsabile della Segreteria del Dottorato di Ricerca è stata la signora Chiara Mangini.
Ogni Corso di Dottorato di Ricerca in Matematica, della durata di 3 anni, si è articolato in diversi curricula con tematiche scientifiche inerenti il contenuto di uno o più dei seguenti settori scientifico-disciplinari:
MAT/02 Algebra
MAT/03 Geometria
MAT/05 Analisi Matematica
MAT/06 Probabilità e Statistica Matematica
MAT/07 Fisica Matematica
MAT/08 Analisi Numerica
Hanno avuto accesso al Corso i laureati in Matematica, Fisica, Informatica, Ingegneria, Scienze Statistiche ed Economiche. Il Corso di Dottorato è stato finalizzato alla formazione di ricercatori di alto livello nei settori scientifico-disciplinari sopra elencati, fornendo le competenze necessarie per esercitare attività di ricerca di elevata qualificazione scientifica presso università, enti pubblici o soggetti privati , e una preparazione adeguata all'accesso alla docenza universitaria.
Le attività di formazione si sono articolate in attività didattiche e di ricerca. L'attività didattica ha previsto insegnamenti specialistici avanzati, corsi di base monografici, seminari nonché partecipazioni a scuole nazionali ed internazionali. L'attività di ricerca si è concretizzata nella elaborazione e nella esecuzione di un progetto di ricerca su argomenti originali, con la supervisione di docenti dell'Università di Bari, oppure di altre Università, sia italiane che straniere. I risultati ottenuti nell'ambito del progetto di ricerca sono stati esposti in seminari e hanno formato oggetto di una dissertazione scritta (Tesi di Dottorato), sottoposte al vaglio della Commissione Giudicatrice per il conferimento del titolo.
